Universidad de Vigo y CSIC publican los primeros datos de la secuenciación del genoma del mejillón gallego

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Universidad de Vigo y CSIC publican los primeros datos de la secuenciación del genoma del mejillón gallego

El trabajo de los investigadores, desarrollado durante cinco años, se publicó en la revista ‘PLOS ONE’

Universidad de Vigo y CSIC publican los primeros datos de la secuenciación del genoma del mejillón gallego

La investigación ponen de manifiesto a complejidad del genoma, así como el alto contenido de repeticiones

 

Duvi | Vigo
En el año 2010 investigadores e investigadoras del Grupo de Filoxenómica de la Universidad de Vigo y del Grupo de Inmunoloxía y Genómica del Instituto de Investigaciones Marinas de Vigo del Consejo Superior de Investigaciones Científicas, CSIC, iniciaron un proyecto financiado por la Xunta con el objetivo de conocer en profundidad el genoma del mejillón cultivado en Galicia, Mytilus galloprovincialis, un molusco bivalvo que tiene una grande importancia, tanto en la acuicultura como en la biología, pero cuyo conocimiento genómico sigue a ser escaso, lo que dificulta el suyo manejo tecnificado y mejora genética. Cinco años después, los y las investigadoras de ambas dos instituciones, liderazgos en el caso de la Universidad de Vigo por Carlos Canchaya y en el del CSIC por Antonio Figueras, obtuvieron codo a codo la primera versión del genoma del mejillón gallego, lo que les permitirá iniciar un estudio de los genes de este molusco bivalvo hasta conseguir su secuenciación y anotación completa.

 

La investigación, publicada en la revista PLOS ONE, se realizó íntegramente en Vigo y mientras que Carlos Canchaya, junto a David Posada y María Murgarella se ocuparon de la ensamblaje y anotación de las secuencias generadas en este proyecto, los y las investigadoras del CSIC se encargaron, fundamentalmente, del trabajo en laboratorio y análisis de los genes de inmunidad.

“El que venimos hasta el momento del genoma del mejillón los indican que es un genoma muy complejo, con un alto contenido de secuencias repetidas y un elevado número de polimorfismos”, explican Canchaya y Figueras, que señalan que, “al comparar el genoma del mejillón con los genomas de otros moluscos, identificamos un mayor número de genes con funciones adaptativas, tales cómo los de detoxificacion y mantenimiento de estructuras ciliares”. ambos investigadores aseguran que aunque el borrador del genoma poda mejorar en el futuro la medida que se incorporen nuevas rondas de secuenciación, “estamos ya en posición de afondar en la caracterización de numerosos genes importantes, como aquellos relacionados con la respuesta inmune”, avanzan Figueras y Canchaya.

En la búsqueda de la caracterización completa de los genes y sus funciones

El equipo de científicos se dedicará los próximos meses a completar el genoma del mejillón poniendo énfasis en la caracterización completa de sus genes y sus funciones. El conocimiento de los genes del mejillón permitirá comprender mejor la genética de este bivalvo, abriendo nuevas posibilidades de estudios a escala genómica, lo que permitirá en un futuro próximo explotar su potencial biotecnológico.

Centrado en distintos aspectos y aplicaciones del análisis de genes y genomas, el Grupo de Filogenómica de la Universidad de Vigo está desarrollando en la actualidad varios proyectos de investigación que involucran tecnologías de secuenciación masiva de genomas en invertebrados marinos, en particular de moluscos, y para el estudio de cánceres en humanos y moluscos. Por su parte, el Grupo de Inmunología y Genómica del CSIC trabaja para incrementar el conocimiento sobre transcriptómica y proteómica de la respuesta inmune de pescados y moluscos frente a patógenos, identificación de genes que se pueden emplear como marcadores en procesos de selección genética y mejorar la respuesta inmune mediante lo uso de inmunoestimulantes y vacunas.

Fuente:

Duvi

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